RN001 RNA快速提取试剂盒使用注意事项和常见疑问解答

一、使用注意事项:

1、细胞数建议不超过300万,最多不超过500万,否则可能会堵塞离心柱。当细胞数较多时(例如使用6cm dish),裂解后可以先12000g离心1分钟,然后取上清加等体积乙醇,充分混匀后上柱;

2、如果加入乙醇后有显著的沉淀产生,则用枪吹打,将沉淀吹至看不见为止,然后上柱;

3、4000g离心1分钟后,如果柱子中仍然有液体残留,可以用12000g离心;

4、对于细胞量很少的样品,或者对RNA产量要求较高的情况:

实验开始前可以先把洗脱液放到65度,加入洗脱液后,可以室温放置1~2分钟,使RNA充分溶解,然后离心,然后再将得到的RNA加入柱子中放置5分钟,重复洗脱一次。

5、洗脱液的体积不可太少或太多,建议通常加20~30微升洗脱液即可。

6、如果实验对极少量的基因组残留很敏感,可以在4000g离心后,用随试剂盒附赠的DNA酶处理:每个样品的柱子中央加入12 ul稀释好的DNase(按照2 ul DNA酶+10 ul ddH2O的比例稀释,用枪吹打混匀)

二、常见疑问解答

1、这个试剂盒能不能加入裂解液以后先冻存起来,等到样品都收集齐了再一起做?
答:细胞样品可以加入裂解液后,充分混匀,vortex震荡使细胞充分裂解,然后冻存于-80度。理论上能保存的时间跟TRIzol保存的时间相当。具体操作如下:

(1)弃去培养基,加200微升PBS,轻轻摇晃几下培养皿,弃去PBS。

(2)加500ul裂解液到孔板里,吹打10下,放置1分钟,吸出来到1.5毫升EP管里冻存在-80度。可以放置3个月。操作过程中如果样品多,可以分批操作,以免细胞被晾干导致细胞死亡RNA降解。

2、这个试剂盒能提的最小细胞量是多少?

答:常规的细胞(如293T等及常见的细胞,如癌细胞等),最低5万个就可以提出RNA,更少的细胞数需要自己尝试做优化。对于T、B细胞等免疫细胞,由于其体积远小于常规细胞(大约只有常规细胞的几十分之一),因此能提取的最低细胞数需要明显增加,最低需要100万以上。

3、关于组织RNA的提取,有什么需要注意的吗?

答:本试剂盒提取细胞样品的RNA最简便,提取组织样品时有一定的局限,只能提取内脏组织、肿瘤组织等相对易于裂解的组织。提取组织样品时,样品用量不可过多,建议用5mg组织。充分匀浆后,需要vortex振荡,然后在室温放置5分钟,以使组织充分裂解,然后离心,将上清转入新的EP管,加等体积无水乙醇混匀,上柱。

4、怎样操作能得到尽量多的RNA?

答:(1)首先细胞数需要合适,通常6孔板或35mm培养皿,细胞培养至90%以上的密度最佳。(2)PBS清洗细胞时,轻柔晃动几下培养皿即可(注意勿吹打,以免丢失细胞),充分吸净PBS后,加入裂解液。如果样品较多,建议每吸去2个孔就加入裂解液,不要让细胞处于没有液体覆盖的情况下超过1分钟,否则细胞极易被晾干导致快速死亡,从而导致RNA大量降解。建议在干净的实验台上操作,不要在有风吹的超净台操作,以免液体蒸发过于迅速。(3)加入裂解液后,吹打10次左右,可以在室温放置1~2分钟,以充分裂解细胞,然后吸到EP管中,vortex,加等体积无水乙醇。(4)洗脱时,可以先将洗脱液预热到65度,然后加入20~30 ul到离心柱的膜中央,室温放置1~2分钟,然后上柱离心。然后可以将液体再次加回到离心柱中,放置5分钟,离心。(5)RNA的产量取决于细胞量,最多能提40 ug。

5、这个试剂盒的基因组DNA是如何去除的?

裂解后,加等体积无水乙醇上柱时,硅胶膜能够相对特异性的吸附RNA,绝大部分DNA和蛋白自等杂质会被离心下去,RNA留在膜上。再用可选步骤中的DNA酶处理,能够进一步去除基因组。如果qPCR引物来自参考文献或设计qPCR引物时采用了跨内含子的设计,则无需DNA酶处理也可,因为目前文献中常用的引物基本都是跨内含子设计的(内含子长度通常较长),在qPCR的条件下,只能检测到cDNA的表达,而不会检测到基因组,因此即使模板中有少量的基因组残留也检测不到,不会对结果产生影响。

 

使用RN001进行革兰氏性菌的RNA提取步骤:

1、 12000g离心2分钟,用移液器弃去上清,收集菌体

2、 加入10 mg/ml溶菌酶150 μl,涡旋重悬菌体,37酶解30分钟。

3、 上述反应结束后,加入500 μl的裂解液,用移液器吹打20~30次左右,室温放置5分钟使之充分裂解。

4、 向上述裂解产物中加入等体积的无水乙醇,充分混匀后,上柱,按照说明上的步骤继续后续的操作。

5、 一定要进行DNA酶处理。

 

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